A játékban egy Pathfinder nevű hőssel kell új élhető bolygót keresnünk az emberiségnek az Androméda-galaxisban. Az Ark nevű telepes hajón érkezünk meg az Androméda galaxisba, és a Tempest nevű hajónkkal járhatjuk be, mint a trilógiában a Normandy sr1 és 2-vel. A hajónk belsejét tetszés szerint átrendezhetjük. Csupa új helyszín, eddig ismeretlen fajok és rengeteg aktuális probléma is vár majd ránk.
